Uno de los puntos cruciales de la negociación ha sido, y sigue siendo, el adecuado tratamiento penal de los distintos delitos cometidos en el marco del conflicto armado. El debate, aún no concluido, ha girado sobre la posibilidad de recurrir a medidas excepcionales como el indulto o la amnistía; sobre los límites que establecen los crímenes internacionales y también sobre las posibilidades y consecuencias jurídicas de la utilización de la figura del delito político y la definición y alcance de los que se pueden considerar sus delitos conexos.
Con el ánimo de hacer su aportación a este debate, el ICTJ ofrece en este análisis algunos planteamientos que pueden contribuir a la conceptualización y desarrollo de la futura ley de amnistía y, por tanto, a la futura implementación de la Jurisdicción Especial para la Paz.